A madárinfluenza lappangási ideje néhány órától 21 napig tart a vírus erősségétől, a fertőzöttek mennyiségétől, a fertőzött állat ellenállóképességétől, az állat testének nagyságától, a fertőzöttség időtartamától, az állat tápláltságától, a környezettől valamint attól függően, hogy a környéken vannak-e a járványt elősegítő tényezők. Az erősen kórokozó madárinfluenzának rödid a lappangási ideje, heves kimenetelű, magas az elhullási arány. A lappangási idő alatt is fertőz.